Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Uhrf2Q7TMI3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Uhrf2Q7TMI3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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