Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms