Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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