Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Msl2Q69ZF8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms