Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprdQ64487 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprdQ64487 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms