Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms