Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
JrkQ60976 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms