Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf3Q60765 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atf3Q60765 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atf3Q60765 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atf3Q60765 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Atf3Q60765 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf3Q60765 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms