Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms