Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elf3Q3UPW2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elf3Q3UPW2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms