Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Otud5Q3U2S4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otud5Q3U2S4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otud5Q3U2S4 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms