Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf149Q3U2C5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms