Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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