Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms