Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpusd2Q149F1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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