Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TrioQ0KL02 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms