Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Hoxc4Q08624 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxc4Q08624 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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