Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Siah2Q06986 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms