Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Sh3bp2Q06649 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp2Q06649 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms