Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox12Q04890 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms