Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mesp1P97309 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mesp1P97309 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms