Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Arf1P84078 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Arf1P84078 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms