Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms