Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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