Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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