Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CntfP51642 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CntfP51642 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CntfP51642 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CntfP51642 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CntfP51642 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CntfP51642 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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