Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
TspoP50637 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TspoP50637 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
TspoP50637 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
TspoP50637 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TspoP50637 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
TspoP50637 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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TspoP50637 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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TspoP50637 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
TspoP50637 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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