Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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