Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ThpoP40226 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ThpoP40226 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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