Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtprkP35822 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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