Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc3P33622 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms