Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxc11P31313 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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