Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pabpc1P29341 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms