Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprmP28828 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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