Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tgfb2P27090 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms