Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PdgfraP26618 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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