Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd12P23812 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd12P23812 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms