Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PparaP23204 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PparaP23204 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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PparaP23204 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PparaP23204 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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