Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fcer1aP20489 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fcer1aP20489 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fcer1aP20489 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fcer1aP20489 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fcer1aP20489 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fcer1aP20489 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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