Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TP20293 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TP20293 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TP20293 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TP20293 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TP20293 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TP20293 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TP20293 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TP20293 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TP20293 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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