Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdgfaP20033 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PdgfaP20033 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PdgfaP20033 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PdgfaP20033 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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PdgfaP20033 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PdgfaP20033 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PdgfaP20033 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms