Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P18533 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P18533 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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