Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18524 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18524 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18524 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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