Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Hoxb1P17919 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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