Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms