Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sptan1P16546 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms