Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P01641 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P01641 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P01641 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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