Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Foxd2O35392 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Foxd2O35392 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.8 ms