Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Arfgef1G3X9K3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms