Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp988F6VKC7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.7 ms